Ton vétérinaire t'a donné un traitement pour ça ?
Les rats sont très sujets aux problèmes respiratoires, et peuvent facilement devenir chroniques si ce n'est pas soigné à temps. Si elle vient d'animalerie elle a probablement été élevée sur copeaux, donc elle a pu développer une fragilité à ce niveau que l'autre n'a pas forcément. Il conviendrait je pense de revoir ton vétérinaire pour un traitement adapté.
Avant de penser à l'allergie je commencerais pas explorer les pathologies courantes à ta place, mais tu peux déjà faire un test très simple, remplace toute la litière par du sopalin blanc tout simple (à changer deux à trois fois par jour) pendant quelques temps et tu verras si les éternuements se calment.